노하우는 아니고요.
pdf invader라는 프로그램이 있습니다.
가격은 한 200백만원 정도하는걸로 알고있어요.
글짜 꺠짐없이 완벽지원이 되죠..^^

Quark파일을 PDF로 변환하기 참 어렵지요
베리님이 말씀하신 invader를 이용하면 돼지만 이또한 가격에 부담이 있지요
OS X는 기본적으로 PDF를 지원합니다
OS X에서 잘  돌아가는 프로그램을 쓰시면 그 문제는 간단히 해결 되리라 봅니다
프로그램은 아시다시피 인디자인이나 엠레이아웃 같은 프로그램이 있구요
물론 두 프로그램 모두 장단점을 가지고 있습니다
인디자인두 최근에 개발을 마치고 판매에 들어간걸로 알구 있고 엠레이아웃도 조만간 업그래이드 버젼이 나오면 Quark파일도 불러 들인다고 하네요(기대됩니다) 인디자인도 마찬가지구요 문제는 서체부분이 남았네요^^
각각 두 프로그램 모두 기본적으로 200종 정도에 서체를 붙여 주더군요

ps 화일은 쿼에서 저장시 포스트스크립트로 저장하시면 됩니다. 그 뒤에 아크로바트디스틸러로 프린트하시면 되는 걸로 알고 있습니다.
또한 위에서 말씀하신 인디자인이란 프로그램으로 pdf화일을 만드는 것은 서체만 조정을 하시면 괜찮은 화일을 만드실 수 있을 겁니다.
저두 24p 작업한 것을 두 개나 쿼에서 인디자인으로 pdf화일을 만들어 웹에 올린 적이 있습니다. 도움이 되었는지 모르겠습니다.

추가로 ps화일은 쿼에서 프린트할 때 general말고 그 밑으로 포스트스크립트로 체크하신다음에 프린트하시면 저장화일이 생깁니다.

참고로, 윤체나 산돌 트투타입은 그냥 변환하면 깨집니다.
별도의 프로그램을 사용해야 합니다. 즉 PDF 인베더 같은 것..
이점 알고 사용하세요.